簸箕柳AP3 同源基因SsMADS 的克隆与特性分析

陈英,关亚丽,程强,曹友志,黄敏仁*
南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室,南京210037

通信作者:黄敏仁;E-mail: mrhuang@njfu.com.cn;Tel: 025-85427412

摘 要:

用 cDNA 末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法从簸箕柳雄花序中克隆了一个 AP3 同源基 因的 cDNA,长 826 bp,包括完整的编码区、5'-UTR 和 3'-UTR,并将其相应的基因命名为 SsMADS。该基因由 7 个外显 子和6个内含子组成,编码区长723 bp,编码241个氨基酸,其N-端具有典型的MADS保守结构域。序列分析表明,SsMADS 编码的氨基酸序列与毛果杨(Populus trichocarp) AP3 同源蛋白有 95.7% 相似性,与其他几种柳属植物的 AP3 同源蛋白相 似性达 96.1%~99.6%。实时定量 RT-PCR 表明,SsMADS 在叶、茎和根中表达量极低,在花序中表达量较高,并且其表达 量在花器官的早中期发育阶段逐步提高,说明该基因在簸箕柳花器官的发育中起作用。

关键词:簸箕柳;SsMADS;AP3;实时定量RT-PCR;系统进化树分析

收稿:2007-04-06   修定:2007-05-14

资助:国家自然科学基金(30471406)。

簸箕柳AP3 同源基因SsMADS 的克隆与特性分析

陈英,关亚丽,程强,曹友志,黄敏仁*
南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室,南京210037

Corresponding author: ; E-mail: mrhuang@njfu.com.cn; Tel: 025-85427412

Abstract:

用 cDNA 末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法从簸箕柳雄花序中克隆了一个 AP3 同源基 因的 cDNA,长 826 bp,包括完整的编码区、5'-UTR 和 3'-UTR,并将其相应的基因命名为 SsMADS。该基因由 7 个外显 子和6个内含子组成,编码区长723 bp,编码241个氨基酸,其N-端具有典型的MADS保守结构域。序列分析表明,SsMADS 编码的氨基酸序列与毛果杨(Populus trichocarp) AP3 同源蛋白有 95.7% 相似性,与其他几种柳属植物的 AP3 同源蛋白相 似性达 96.1%~99.6%。实时定量 RT-PCR 表明,SsMADS 在叶、茎和根中表达量极低,在花序中表达量较高,并且其表达 量在花器官的早中期发育阶段逐步提高,说明该基因在簸箕柳花器官的发育中起作用。

Key words: 簸箕柳;SsMADS;AP3;实时定量RT-PCR;系统进化树分析

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